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在写作论文时，优美的图形会提升整篇文章的质量，更容易受到编辑或审稿人的青睐。因此搞科研的人想必都明白“一图胜千言”这个道理。 一张兼顾科学性与美观性的图片，不仅有助于更好地阐述和展示科学问题、流程方法、研究结果等，同时也能大大提升文章的档次。本期内容将为大家介绍两类作图工具——数据可视化分析和科研绘图。
数据可视化分析 # Graphpad Prism GraphPad Prism是一款集生物统计、曲线拟合和科学绘图于一体的数据分析和可视化软件，它可以通过直接输入原始数据，自动进行基本的统计分析，如计算标准差和P值等，同时生成高质量的科学图表。 GraphPad Prism绘制的图形中，几乎所有元素都可以自由编辑，包括坐标轴、标题、图例、刻度、辅助线、网格线等，每一个元素的形状、颜色、方向等都可以自由的定义，从而绘制更加美观，更加符合使用者需要的图形。
# Origin Origi数据分析软件是一款强大、易于使用的数据分析和制图软件，广泛应用于各个领域，如科研、工业、教育和医疗等。该软件提供了多种高级分析和绘图工具，有助于用户有效地处理和解释复杂数据，并生成具有高质量的专业图表和报告。 它支持从多种文件格式读取数据，包括Excel、CSV、ASCII等，并提供了多种优秀的分析和可视化工具，包括统计、信号处理、图像处理和曲线拟合等。此外，Origin还提供了一系列绘图模板，可简化绘图流程，并提供自动化分析工具，如自动拟合、自动标记和自动更新等，以便用户更快地生成良好的分析和图表结果。另外，Origin还支持编写自定义jupyter式的代码，据我了解它可以读入python脚本，便于用户进行更深入的分析和模型建立。
▲Origin绘制小提琴图 ▲Origin绘制柱状和条形图
# R语言 R语言的基础绘图系统由RossIhaka编写，功能非常强大，主要由graphics包和grDevices 包组成，它们在启动R时会自动加载。基础绘图系统中有两类函数，一类是高水平作图函数，另一类是低水平作图函数。 所谓高水平作图函数是用于直接产生图形的函数，包括 plot( )、hist( )、boxplot( )和pairs( )等。低水平作图函数是用于在高水平作图函数所绘图形的基础上添加新的图形或元素的函数，包括points( )、lines( )、text( )、title( )、legend( )和axis( )等。
▲R语言绘制散点图
▲R语言绘制箱线图
# Image J Image J是一个免费且强大的图像处理软件，其由National Institutes of Health基于java特点开发，可运行于Microsoft Windows，Mac OS，Mac OS X，Linux，和SharpZaurus PDA等多种平台。 ImageJ的功能如下： 1. 图像的区域和像素统计（大小），长度，角度。阳性点密度和数量。 2. 光密度或辉度，并制备密度直方图和线性图。 3. 结构分析，如“土壤结构特征”，“表面几何特征 ”等。 4. 卷积、Sholl分析、傅里叶分析。
▲Image J对WB条带进行灰度值分析
科研绘图 # Biorender 网址：https://www.biorender.com/ Biorender是一款专为生命科学研究者和医学专业人员设计的图形工具，旨在帮助用户创建高质量、专业水平的生物科学插图。它提供了丰富的生物学元素和模板，使用户能够快速制作出各种生物科学相关的图表、示意图和流程图。Biorender不仅可以用于科研论文和演示文稿，还可以用于教学材料、海报和宣传资料等。 Biorender的功能特点如下： 1. 丰富的生物学元素库 Biorender提供了大量的生物学元素，包括细胞器、分子结构、DNA片段、蛋白质、细菌等。这些元素都经过精心设计，具有高度可视化效果，并且可以根据需要进行调整和修改。 2. 多种模板选择 Biorender提供了多种预设模板，涵盖了常见的实验流程、细胞结构、信号传导路径等主题。用户可以根据自己的需求选择合适的模板，并在此基础上进行修改和定制。 3. 灵活的编辑工具 Biorender提供了多种编辑工具，使用户能够轻松创建和编辑图表。用户可以添加文本、箭头、标签等注释，还可以调整元素的大小、颜色和位置。此外，Biorender还支持导入外部图片和数据，方便用户将自己的实验结果直接插入图表中。 4. 高品质输出 Biorender支持多种输出格式，包括PNG、PDF和SVG等。用户可以根据需要选择合适的输出格式，并且可以自定义分辨率和尺寸。无论是在打印品质还是在屏幕显示上，Biorender都能保证图像的清晰度和细节。 5. 团队协作与共享 Biorender提供了团队协作和共享功能，使多个用户能够同时编辑同一个图表。用户可以邀请他人加入团队，并设置不同权限级别，以便进行协作工作。此外，Biorender还提供了在线存储和分享功能，方便用户随时随地访问自己的图表。
# Figdraw 网址：https://www.figdraw.com/ 科研者之家（Home for Researchers）在去年二月份发布了国内首个开放式在线绘图平台：Figdraw。 Figdraw填补了国内没有类似平台的空白，得以让更多中国科研者零基础就能够实现科研绘图自由。任何人都可以登录Figdraw，通过对矢量素材进行简单的拖拉、拆分，编辑，组图后制作符合学术发表要求的高清图。 Figdraw科研绘图三部曲：
# Adobe Photoshop Adobe Photoshop 简称PS，是一款专门用来编辑位图比如照片的软件，强大到人人都知道。PS从1987年开始出1.0版本至今已有三十多年历史。是目前出版行业处于垄断地位的软件，可以说作图必定会用到。对科研工作者来说，写论文投稿必须会作图。很多期刊明确要求使用PS来制作投稿的图片。
▲用PS处理条带
▲PS加标尺
# Adobe illustrator Adobe illustrator，简称Ai，是一种应用于出版、多媒体和在线图像的工业标准矢量插画的软件。该软件主要应用于印刷出版、海报书籍排版、专业插画、多媒体图像处理和互联网页面的制作等，也可以为线稿提供较高的精度和控制，适合生产任何小型设计到大型的复杂项目。AdobeI llustrator作为全球最著名的矢量图形软件，以其强大的功能和体贴用户的界面，已经占据了全球矢量编辑软件中的大部分份额。
▲AI排版图片
▲用AI绘图
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发表于 2024-11-7 16:03:07
